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Tipps & Tricks

Effiziente Python-Bibliotheken für eine angenehme Datenbereinigung

7 min Lesezeit
Effiziente Python-Bibliotheken für eine angenehme Datenbereinigung

Einführung in die Datenbereinigung

Datenbereinigung ist oft eine mühsame Aufgabe, die jedoch einen Großteil der Zeit von Datenprofis in Anspruch nimmt. Bevor Modelle trainiert oder Dashboards erstellt werden können, müssen häufig inkonsistente Spaltennamen, verstreute Nullwerte, Typinkonsistenzen, doppelte Datensätze und fast übereinstimmende Zeichenfolgen bearbeitet werden.

Obwohl die Standardbibliothek pandas viele dieser Aufgaben bewältigt, wird sie bei komplexen und unordentlichen realen Daten schnell unübersichtlich, langsam und fehleranfällig. Die in diesem Artikel vorgestellten Bibliotheken beschleunigen den Prozess und bieten bessere Abstraktionen, intelligentere Voreinstellungen und klarere APIs.

Im Folgenden werden Bibliotheken vorgestellt, die folgende Aufgaben übernehmen:

  • Schnelles Erkennen und Beheben struktureller Probleme in DataFrames
  • Standardisierung unordentlicher Zeichenfolgen und kategorialer Daten im großen Maßstab
  • Profilierung von Datensätzen zur Aufdeckung von Qualitätsproblemen, bevor sie Fehler verursachen
  • Durchsetzung von Schemata und Validierung von Daten an den Grenzen der Datenpipeline
  • Bereinigung und Umformung unordentlicher Daten mit minimalem Aufwand

1. pyjanitor: Fluent und kettebare Datenbereinigung

pyjanitor ist ein Python-Paket, das auf pandas aufbaut und eine klare, verb-basierte API für gängige Datenbereinigungsaufgaben bietet. Es ermöglicht das Verketten von Operationen – Spalten umbenennen, Nullwerte entfernen, kategoriale Daten kodieren, Zeilen filtern – alles in einer einzigen, lesbaren Pipeline, anstatt Änderungen über mehrere Zuweisungen zu verstreuen.

Es erweitert pandas mithilfe des Method-Chaining-Musters, sodass kein neues mentales Modell angenommen werden muss. In pyjanitor:

  • Wird das Method-Chaining verwendet, um fragmentierte, schwer lesbare Sequenzen von df = df[…]-Zuweisungen durch eine einzige deklarative Pipeline zu ersetzen.
  • clean_names() macht Spaltenüberschriften durch Kleinschreibung, Entfernen von Leerzeichen und speziellen Zeichen in einem Aufruf sauber.
  • collapse_levels() vereinfacht MultiIndex-Spalten, die durch groupby-Operationen erzeugt werden, in einfache Zeichenfolgen.
  • Bedingte Joins, zeilenbasierte Transformationen und Hilfsfunktionen für fehlende Werte sind ebenfalls als kettebare Methoden verfügbar.

2. Great Expectations: Datenvalidierung und Qualitätsprüfungen

Great Expectations ist ein Framework zur Datenqualität, das es ermöglicht, Erwartungen darüber zu definieren, zu dokumentieren und durchzusetzen, wie die Daten aussehen sollten. Anstatt einmalige assert-Anweisungen zu schreiben, die in der Produktion stillschweigend fehlschlagen, wird eine Suite benannter Prüfungen erstellt, die Spaltentypen, Wertebereiche, Nullraten und referenzielle Integrität abdecken – Prüfungen, die gegen jede Charge eingehender Daten ausgeführt werden.

Es integriert sich mit pandas, Spark und SQL-Datenbanken und erstellt lesbare Validierungsberichte, die mit nicht-technischen Stakeholdern geteilt werden können. Das deklarative Erwartungsmodell dient auch als lebende Dokumentation: Die Spezifikation erklärt jedem Leser genau, was „saubere Daten“ für eine bestimmte Pipeline-Phase bedeutet. Zu den Funktionen gehören:

  • Erwartungen decken Spaltenpräsenz, Typbeschränkungen, Wertebereiche, Einzigartigkeit, Regex-Muster und Verteilungskontrollen ab.
  • Validierungsergebnisse werden als durchsuchbare HTML-Berichte mit Pass/Fail-Übersichten pro Erwartung dargestellt.
  • Daten-Dokumente generieren automatisch die Daten-Dokumentation aus den Erwartungssuiten und halten die Spezifikationen synchron mit dem Code.
  • Checkpoints ermöglichen die Ausführung der Validierung als Schritt innerhalb von Airflow, Prefect oder jeder anderen Orchestrierungspipeline.

3. ftfy: Reparatur von kaputtem Unicode und Textkodierungsproblemen

ftfy, was für „fixes text for you“ steht, ist eine kleine, fokussierte Bibliothek, die mojibake, falsche Kodierungen und beschädigten Unicode repariert, die in realen Textdaten auftreten. Wenn Sie jemals verzerrte akzentuierte Zeichen aus einer CSV-Datei gesehen haben, die über Excel exportiert wurde, kümmert sich ftfy darum.

Die Bibliothek hat einen einzigen Zweck: kaputte Texte zu erkennen und die wahrscheinlich beabsichtigte Version zurückzugeben. Diese Fokussierung macht sie äußerst nützlich beim Aufbau von Pipelines, die nutzergenerierte Inhalte, gescrapte Webdaten oder Datensätze verarbeiten, die durch mehrere veraltete Systeme gegangen sind. ftfy erledigt Folgendes:

  • Erkennt und korrigiert Kodierungsfehler, die durch falsch identifizierte oder doppelt kodierte Zeichencodierungen verursacht werden.
  • Behandelt mojibake aus gängigen Quellen.
  • Normalisiert Unicode in konsistente Formen und entfernt unsichtbare Zeichen und Nullbreitenräume, die nachgelagerte Übereinstimmungen stören.
  • Funktioniert als einfacher ftfy.fix_text(s)-Aufruf, ohne dass für die meisten Anwendungsfälle eine Konfiguration erforderlich ist.

4. ydata-profiling: Sofortige Datensatzprüfungen

ydata-profiling, früher bekannt als pandas-profiling, erstellt aus jedem DataFrame in einer einzigen Codezeile einen umfassenden Bericht zur explorativen Datenanalyse (EDA). Es deckt fehlende Werte, doppelte Zeilen, schiefe Verteilungen, hochgradige kategoriale Daten, Korrelationen und Ausreißer auf – die vollständige Checkliste von Aspekten, die man sonst manuell überprüfen würde, bevor man die Daten bearbeitet.

Der Bericht ist interaktives HTML, das mit Teamkollegen geteilt oder in ein Notizbuch eingebettet werden kann. Die Ausführung zu Beginn eines neuen Datensatzes gibt sofort eine Übersicht darüber, wo die Qualitätsprobleme liegen, sodass die Bereinigungsanstrengungen an den richtigen Stellen konzentriert werden, anstatt während des Modelltrainings oder bei Dashboard-Abfragen entdeckt zu werden. Zu den Hauptmerkmalen gehören:

  • Erstellt ein vollständiges statistisches Profil, einschließlich Verteilungsdiagrammen, Korrelationsmatrizen und Heatmaps für fehlende Werte.
  • Markiert doppelte Zeilen, konstante Spalten, hochkorrelierte Paare und Spalten mit verdächtiger Kardinalität ohne Konfiguration.
  • Gibt Berichte im HTML-, JSON- oder Notizbuch-Widget-Format aus, was die Weitergabe an technische und nicht-technische Zielgruppen erleichtert.
  • ProfileReport akzeptiert jeden pandas-DataFrame und kann zwei Datensätze nebeneinander vergleichen, um Drift zwischen Trainings- und Testteilen zu erkennen.

5. Cerberus: Leichte Schema-Validierung für beliebige Datenstrukturen

Cerberus ist eine Schema-Validierungsbibliothek für Python-Dictionaries und verschachtelte Datenstrukturen. Sie ist nützlich, wenn Daten in Form von JSON ankommen – wie API-Antworten, Ereignisprotokolle, Konfigurationsdateien und Exporte aus Dokumentenspeichern –, wo eine Validierung auf Spaltenebene nicht zutrifft, aber dennoch Typen, erforderliche Felder, Werteinschränkungen und benutzerdefinierte Regeln durchgesetzt werden müssen.

Cerberus hat keine Abhängigkeiten, läuft überall und lässt sich leicht in eine Bereinigungsfunktion oder Datenaufnahme-Pipeline einbetten. Sie definieren ein Schema als einfaches Python-Dictionary, rufen validator.validate(document) auf und überprüfen die Fehler pro Feld. Die Fehlermeldungen sind so strukturiert, dass sie protokolliert, aus einer API zurückgegeben oder an den Absender der fehlerhaften Daten weitergeleitet werden können. Hier sind einige nützliche Funktionen:

  • Schema-Definitionen sind einfache Python-Dicts ohne spezielle Syntax; Feldnamen werden auf Regel-Dictionaries mit Typ-, Erforderlich-, Erlaubt- und Regex-Schlüsseln abgebildet.
  • Koerzierungsregeln wandeln eingehende Strings in int, float oder datetime im Rahmen der Validierung um und kombinieren Typprüfung und Umwandlung in einem Schritt.
  • Die Validierung verschachtelter Dokumente verarbeitet beliebig tief verschachtelte JSON-Strukturen, einschließlich Listen von Unterdokumenten.
  • Benutzerdefinierte Validatoren sind einfach Python-Funktionen, die spezifische Regeln wie gültige SKUs, ISO-Ländercodes und interne ID-Formate leicht hinzufügen können, ohne externe Abhängigkeiten.

Zusammenfassung und nächste Schritte

Hier ist eine kurze Übersicht über die Bibliotheken:

  • pyjanitor: Kettebare Datenbereinigung, Spaltennormalisierung, fließende pandas-Pipelines.
  • Great Expectations: Schema-Validierung, Datenqualitätsprüfungen, Durchsetzung an Pipeline-Grenzen.
  • ftfy: Unicode-Reparatur, Korrektur von Kodierungsfehlern, Textnormalisierung.
  • ydata-profiling: Automatisierte EDA-Berichte, Prüfungen auf fehlende Werte, Erkennung von Datensatzdrift.
  • Cerberus: JSON/Dict-Schema-Validierung, Typumwandlung, Überprüfung verschachtelter Dokumente.

Es wird empfohlen, Folgendes auszuprobieren, um herauszufinden, welche Bibliotheken nützlich sind:

  • Erstellen Sie eine wiederverwendbare Bereinigungspipeline mit pyjanitor, die Spaltennamen standardisiert, leere Zeilen entfernt und kategoriale Daten über mehrere Roh-CSV-Dateien kodiert.
  • Fügen Sie einen Great Expectations-Checkpoint zu einem bestehenden Airflow-DAG hinzu und schreiben Sie Erwartungssuiten für drei Ihrer Produktionsdatensätze.
  • Führen Sie ftfy über einen Korpus gescrapeter Textdaten aus und messen Sie, wie viele Datensätze vor und nach der Bereinigung kodierbare Fehler enthielten.
  • Generieren Sie ydata-profiling-Berichte für die Trainings- und Testteile eines Datensatzes, den Sie modellieren, und verwenden Sie die Vergleichsansicht, um Verteilungsdrift zu erkennen.
  • Schreiben Sie ein Cerberus-Schema für eine API-Antwort, die Ihr Team verarbeitet, und integrieren Sie es in die Aufnahmefunktion, um fehlerhafte Datensätze an der Quelle abzulehnen.

Viel Erfolg bei der Datenbereinigung!

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Quellen: kdnuggets

Dieser Text wurde mit Hilfe von künstlicher Intelligenz in Zusammenarbeit mit unserer Redaktion erstellt.

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